自定义 C++ 和 CUDA 扩展¶
创建日期:2018 年 4 月 26 日 | 最后更新:2025 年 3 月 19 日 | 最后验证:2024 年 11 月 05 日
警告
本教程自 PyTorch 2.4 版本起已弃用。请参阅 PyTorch 自定义算子,获取关于使用自定义 C++/CUDA 扩展 PyTorch 的最新指南。
PyTorch 提供了大量与神经网络、任意张量代数、数据处理及其他目的相关的操作。然而,你可能仍然需要一个更定制化的操作。例如,你可能想使用你在论文中找到的一个新颖的激活函数,或者实现一个你在研究中开发的操作。
在 PyTorch 中集成此类自定义操作的最简单方法是使用 Python 编写,通过扩展 Function
和 Module
,如此处所述。这为你提供了自动微分的全部能力(让你无需编写导数函数)以及 Python 通常的表达能力。然而,有时用 C++ 实现你的操作会更好。例如,你的代码可能需要非常快,因为它在你的模型中被频繁调用,或者即使调用次数很少也非常耗时。另一个可能的原因是它依赖于或其他 C 或 C++ 库交互。为了解决这些情况,PyTorch 提供了一种非常简单的方式来编写自定义的 C++ 扩展。
C++ 扩展是我们开发的一种机制,允许用户(你)创建在源代码之外定义的 PyTorch 算子,即与 PyTorch 后端分离。这种方法与原生 PyTorch 操作的实现方式不同。C++ 扩展旨在让你免去将操作与 PyTorch 后端集成相关的大量样板代码,同时为你的基于 PyTorch 的项目提供高度的灵活性。尽管如此,一旦你将操作定义为 C++ 扩展,将其转换为原生 PyTorch 函数主要是一个代码组织问题,如果你决定贡献你的操作到上游,可以在之后处理。
动机与示例¶
本文档的其余部分将通过一个实际示例来讲解如何编写和使用 C++(和 CUDA)扩展。如果你正被追赶,或者如果今天结束前你没完成这个操作就会被解雇,你可以跳过本节,直接前往下一节的实现细节。
假设你提出了一种新型循环单元,发现它与现有最佳技术相比具有优越的属性。这种循环单元类似于 LSTM,但不同之处在于它缺少一个遗忘门并使用指数线性单元 (ELU) 作为其内部激活函数。由于这个单元从不遗忘,我们将其称为 LLTM,即长长时记忆单元。
LLTM 与普通 LSTM 的两个不同之处非常显著,以至于我们无法为我们的目的配置 PyTorch 的 LSTMCell
,因此我们必须创建一个自定义单元。为此,第一个也是最简单的方法——在所有情况下都可能是一个很好的第一步——是在纯 PyTorch 中用 Python 实现我们想要的功能。为此,我们需要继承 torch.nn.Module
并实现 LLTM 的前向传播。这看起来像这样
class LLTM(torch.nn.Module):
def __init__(self, input_features, state_size):
super(LLTM, self).__init__()
self.input_features = input_features
self.state_size = state_size
# 3 * state_size for input gate, output gate and candidate cell gate.
# input_features + state_size because we will multiply with [input, h].
self.weights = torch.nn.Parameter(
torch.empty(3 * state_size, input_features + state_size))
self.bias = torch.nn.Parameter(torch.empty(3 * state_size))
self.reset_parameters()
def reset_parameters(self):
stdv = 1.0 / math.sqrt(self.state_size)
for weight in self.parameters():
weight.data.uniform_(-stdv, +stdv)
def forward(self, input, state):
old_h, old_cell = state
X = torch.cat([old_h, input], dim=1)
# Compute the input, output and candidate cell gates with one MM.
gate_weights = F.linear(X, self.weights, self.bias)
# Split the combined gate weight matrix into its components.
gates = gate_weights.chunk(3, dim=1)
input_gate = torch.sigmoid(gates[0])
output_gate = torch.sigmoid(gates[1])
# Here we use an ELU instead of the usual tanh.
candidate_cell = F.elu(gates[2])
# Compute the new cell state.
new_cell = old_cell + candidate_cell * input_gate
# Compute the new hidden state and output.
new_h = torch.tanh(new_cell) * output_gate
return new_h, new_cell
然后我们可以按预期使用它
import torch
X = torch.randn(batch_size, input_features)
h = torch.randn(batch_size, state_size)
C = torch.randn(batch_size, state_size)
rnn = LLTM(input_features, state_size)
new_h, new_C = rnn(X, (h, C))
自然地,如果可能且合理,你应该使用这种方法来扩展 PyTorch。由于 PyTorch 针对 CPU 和 GPU 提供了高度优化的操作实现,由诸如 NVIDIA cuDNN、Intel MKL 或 NNPACK 等库提供支持,因此像上面这样的 PyTorch 代码通常足够快。然而,我们也可以看到为什么在某些情况下还有进一步提升性能的空间。最明显的原因是 PyTorch 对你正在实现的算法一无所知。它只知道你用来组合算法的各个操作。因此,PyTorch 必须单独执行你的操作,一个接一个。由于对操作实现(或核函数)的每次单独调用(可能涉及启动 CUDA 核函数)都有一定的开销,这种开销在多次函数调用中可能会变得很显著。此外,运行我们代码的 Python 解释器本身也会降低程序速度。
因此,一个明确的加速方法是用 C++(或 CUDA)重写部分代码,并融合特定组的操作。融合意味着将许多函数的实现组合到一个函数中,这受益于更少的核函数启动以及通过增强对全局数据流的可见性而可以执行的其他优化。
让我们看看如何使用 C++ 扩展来实现 LLTM 的融合版本。我们将首先用纯 C++ 编写它,使用支持 PyTorch 后端大部分功能的 ATen 库,看看它如何轻松地让我们转换 Python 代码。然后,我们将通过将模型的部分移到 CUDA 核函数中,以利用 GPU 提供的海量并行性来进一步加速。
编写 C++ 扩展¶
C++ 扩展有两种方式:它们可以通过 setuptools
进行“提前构建”,或者通过 torch.utils.cpp_extension.load()
进行“即时构建”。我们将从第一种方法开始,稍后讨论第二种方法。
使用 setuptools
构建¶
对于“提前构建”方式,我们通过编写一个使用 setuptools 编译 C++ 代码的 setup.py
脚本来构建 C++ 扩展。对于 LLTM,它就像这样简单
from setuptools import setup, Extension
from torch.utils import cpp_extension
setup(name='lltm_cpp',
ext_modules=[cpp_extension.CppExtension('lltm_cpp', ['lltm.cpp'])],
cmdclass={'build_ext': cpp_extension.BuildExtension})
在这段代码中,CppExtension
是 setuptools.Extension
的一个便捷包装器,它传递正确的包含路径并将扩展语言设置为 C++。等效的普通 setuptools
代码将是
Extension(
name='lltm_cpp',
sources=['lltm.cpp'],
include_dirs=cpp_extension.include_paths(),
language='c++')
BuildExtension
执行许多必需的配置步骤和检查,并管理混合 C++/CUDA 扩展情况下的混合编译。这就是我们目前真正需要了解的关于构建 C++ 扩展的所有内容了!现在让我们看看我们的 C++ 扩展的实现,它位于 lltm.cpp
文件中。
编写 C++ 算子¶
让我们开始用 C++ 实现 LLTM 吧!我们在反向传播中需要的一个函数是 sigmoid 的导数。这段代码足够小,可以用来讨论编写 C++ 扩展时可用的整体环境
#include <torch/extension.h>
#include <iostream>
torch::Tensor d_sigmoid(torch::Tensor z) {
auto s = torch::sigmoid(z);
return (1 - s) * s;
}
<torch/extension.h>
是一个一站式头文件,包含编写 C++ 扩展所需的所有 PyTorch 相关内容。它包含
ATen 库,它是我们用于张量计算的主要 API,
pybind11,这是我们如何为 C++ 代码创建 Python 绑定的方式,
管理 ATen 和 pybind11 之间交互细节的头文件。
d_sigmoid()
的实现展示了如何使用 ATen API。PyTorch 的张量和变量接口是自动从 ATen 库生成的,所以我们可以或多或少地将我们的 Python 实现 1:1 翻译成 C++。torch::Tensor
将是我们所有计算的主要数据类型。其完整的 API 可以在这里查看。请注意,我们还可以包含 <iostream>
或任何其他 C 或 C++ 头文件——我们拥有 C++11 的全部能力可供支配。
注意,在 Windows 上,CUDA-11.5 nvcc 解析 torch/extension.h 时会遇到内部编译器错误。为了解决这个问题,将 Python 绑定逻辑移到纯 C++ 文件中。例如
#include <ATen/ATen.h>
at::Tensor SigmoidAlphaBlendForwardCuda(....)
而不是
#include <torch/extension.h>
torch::Tensor SigmoidAlphaBlendForwardCuda(...)
关于 nvcc bug 的当前开放问题请参阅此处。完整的解决方法代码示例请参阅此处。
前向传播¶
接下来我们可以将整个前向传播移植到 C++
#include <vector>
std::vector<at::Tensor> lltm_forward(
torch::Tensor input,
torch::Tensor weights,
torch::Tensor bias,
torch::Tensor old_h,
torch::Tensor old_cell) {
auto X = torch::cat({old_h, input}, /*dim=*/1);
auto gate_weights = torch::addmm(bias, X, weights.transpose(0, 1));
auto gates = gate_weights.chunk(3, /*dim=*/1);
auto input_gate = torch::sigmoid(gates[0]);
auto output_gate = torch::sigmoid(gates[1]);
auto candidate_cell = torch::elu(gates[2], /*alpha=*/1.0);
auto new_cell = old_cell + candidate_cell * input_gate;
auto new_h = torch::tanh(new_cell) * output_gate;
return {new_h,
new_cell,
input_gate,
output_gate,
candidate_cell,
X,
gate_weights};
}
反向传播¶
目前的 C++ 扩展 API 不提供自动为我们生成反向函数的途径。因此,我们还必须实现 LLTM 的反向传播,它计算损失相对于前向传播中每个输入的导数。最终,我们将把前向和反向函数都放到 torch.autograd.Function
中,以创建一个友好的 Python 绑定。反向函数稍微复杂一些,所以我们不会深入研究代码(如果你有兴趣,Alex Graves 的论文是一个很好的阅读材料,可以了解更多信息)。
// tanh'(z) = 1 - tanh^2(z)
torch::Tensor d_tanh(torch::Tensor z) {
return 1 - z.tanh().pow(2);
}
// elu'(z) = relu'(z) + { alpha * exp(z) if (alpha * (exp(z) - 1)) < 0, else 0}
torch::Tensor d_elu(torch::Tensor z, torch::Scalar alpha = 1.0) {
auto e = z.exp();
auto mask = (alpha * (e - 1)) < 0;
return (z > 0).type_as(z) + mask.type_as(z) * (alpha * e);
}
std::vector<torch::Tensor> lltm_backward(
torch::Tensor grad_h,
torch::Tensor grad_cell,
torch::Tensor new_cell,
torch::Tensor input_gate,
torch::Tensor output_gate,
torch::Tensor candidate_cell,
torch::Tensor X,
torch::Tensor gate_weights,
torch::Tensor weights) {
auto d_output_gate = torch::tanh(new_cell) * grad_h;
auto d_tanh_new_cell = output_gate * grad_h;
auto d_new_cell = d_tanh(new_cell) * d_tanh_new_cell + grad_cell;
auto d_old_cell = d_new_cell;
auto d_candidate_cell = input_gate * d_new_cell;
auto d_input_gate = candidate_cell * d_new_cell;
auto gates = gate_weights.chunk(3, /*dim=*/1);
d_input_gate *= d_sigmoid(gates[0]);
d_output_gate *= d_sigmoid(gates[1]);
d_candidate_cell *= d_elu(gates[2]);
auto d_gates =
torch::cat({d_input_gate, d_output_gate, d_candidate_cell}, /*dim=*/1);
auto d_weights = d_gates.t().mm(X);
auto d_bias = d_gates.sum(/*dim=*/0, /*keepdim=*/true);
auto d_X = d_gates.mm(weights);
const auto state_size = grad_h.size(1);
auto d_old_h = d_X.slice(/*dim=*/1, 0, state_size);
auto d_input = d_X.slice(/*dim=*/1, state_size);
return {d_old_h, d_input, d_weights, d_bias, d_old_cell};
}
绑定到 Python¶
一旦你用 C++ 和 ATen 写好了你的操作,你就可以非常简单地使用 pybind11 将你的 C++ 函数或类绑定到 Python 中。关于 PyTorch C++ 扩展这一部分的疑问或问题,大多可以在 pybind11 文档中找到解答。
对于我们的扩展,必需的绑定代码只有四行
PYBIND11_MODULE(TORCH_EXTENSION_NAME, m) {
m.def("forward", &lltm_forward, "LLTM forward");
m.def("backward", &lltm_backward, "LLTM backward");
}
这里需要注意的一点是宏 TORCH_EXTENSION_NAME
。torch 扩展构建过程会将其定义为你你在 setup.py
脚本中给你的扩展起的名称。在这种情况下,TORCH_EXTENSION_NAME
的值将是“lltm_cpp”。这样做是为了避免在两个地方(构建脚本和你的 C++ 代码)维护扩展名称,因为两者之间的不匹配可能导致棘手且难以追踪的问题。
使用你的扩展¶
现在我们可以开始在 PyTorch 中导入我们的扩展了。此时,你的目录结构可能看起来像这样
pytorch/
lltm-extension/
lltm.cpp
setup.py
现在,运行 python setup.py install
来构建和安装你的扩展。这看起来应该像这样
running install
running bdist_egg
running egg_info
creating lltm_cpp.egg-info
writing lltm_cpp.egg-info/PKG-INFO
writing dependency_links to lltm_cpp.egg-info/dependency_links.txt
writing top-level names to lltm_cpp.egg-info/top_level.txt
writing manifest file 'lltm_cpp.egg-info/SOURCES.txt'
reading manifest file 'lltm_cpp.egg-info/SOURCES.txt'
writing manifest file 'lltm_cpp.egg-info/SOURCES.txt'
installing library code to build/bdist.linux-x86_64/egg
running install_lib
running build_ext
building 'lltm_cpp' extension
creating build
creating build/temp.linux-x86_64-3.7
gcc -pthread -B ~/local/miniconda/compiler_compat -Wl,--sysroot=/ -Wsign-compare -DNDEBUG -g -fwrapv -O3 -Wall -Wstrict-prototypes -fPIC -I~/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/torch/include -I~/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/torch/include/torch/csrc/api/include -I~/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/torch/include/TH -I~/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/torch/include/THC -I~/local/miniconda/include/python3.7m -c lltm.cpp -o build/temp.linux-x86_64-3.7/lltm.o -DTORCH_API_INCLUDE_EXTENSION_H -DTORCH_EXTENSION_NAME=lltm_cpp -D_GLIBCXX_USE_CXX11_ABI=1 -std=c++11
cc1plus: warning: command line option ‘-Wstrict-prototypes’ is valid for C/ObjC but not for C++
creating build/lib.linux-x86_64-3.7
g++ -pthread -shared -B ~/local/miniconda/compiler_compat -L~/local/miniconda/lib -Wl,-rpath=~/local/miniconda/lib -Wl,--no-as-needed -Wl,--sysroot=/ build/temp.linux-x86_64-3.7/lltm.o -o build/lib.linux-x86_64-3.7/lltm_cpp.cpython-37m-x86_64-linux-gnu.so
creating build/bdist.linux-x86_64
creating build/bdist.linux-x86_64/egg
copying build/lib.linux-x86_64-3.7/lltm_cpp.cpython-37m-x86_64-linux-gnu.so -> build/bdist.linux-x86_64/egg
creating stub loader for lltm_cpp.cpython-37m-x86_64-linux-gnu.so
byte-compiling build/bdist.linux-x86_64/egg/lltm_cpp.py to lltm_cpp.cpython-37.pyc
creating build/bdist.linux-x86_64/egg/EGG-INFO
copying lltm_cpp.egg-info/PKG-INFO -> build/bdist.linux-x86_64/egg/EGG-INFO
copying lltm_cpp.egg-info/SOURCES.txt -> build/bdist.linux-x86_64/egg/EGG-INFO
copying lltm_cpp.egg-info/dependency_links.txt -> build/bdist.linux-x86_64/egg/EGG-INFO
copying lltm_cpp.egg-info/top_level.txt -> build/bdist.linux-x86_64/egg/EGG-INFO
writing build/bdist.linux-x86_64/egg/EGG-INFO/native_libs.txt
zip_safe flag not set; analyzing archive contents...
__pycache__.lltm_cpp.cpython-37: module references __file__
creating 'dist/lltm_cpp-0.0.0-py3.7-linux-x86_64.egg' and adding 'build/bdist.linux-x86_64/egg' to it
removing 'build/bdist.linux-x86_64/egg' (and everything under it)
Processing lltm_cpp-0.0.0-py3.7-linux-x86_64.egg
removing '~/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/lltm_cpp-0.0.0-py3.7-linux-x86_64.egg' (and everything under it)
creating ~/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/lltm_cpp-0.0.0-py3.7-linux-x86_64.egg
Extracting lltm_cpp-0.0.0-py3.7-linux-x86_64.egg to ~/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages
lltm-cpp 0.0.0 is already the active version in easy-install.pth
Installed ~/local/miniconda/lib/python3.7/site-packages/lltm_cpp-0.0.0-py3.7-linux-x86_64.egg
Processing dependencies for lltm-cpp==0.0.0
Finished processing dependencies for lltm-cpp==0.0.0
关于编译器的小提示:由于 ABI 版本控制问题,你用来构建 C++ 扩展的编译器必须与构建 PyTorch 所使用的编译器ABI 兼容。实际上,这意味着在 Linux 上你必须使用 GCC 4.9 及更高版本。对于 Ubuntu 16.04 和其他较新的 Linux 发行版,这应该是默认编译器。在 MacOS 上,你必须使用 clang(它没有 ABI 版本控制问题)。最糟糕的情况下,你可以使用你的编译器从源代码构建 PyTorch,然后使用相同的编译器构建扩展。
一旦你的扩展构建完成,你就可以简单地在 Python 中导入它,使用你在 setup.py
脚本中指定的名称。只需确保先 import torch
,因为这会解析动态链接器必须看到的一些符号。
In [1]: import torch
In [2]: import lltm_cpp
In [3]: lltm_cpp.forward
Out[3]: <function lltm.PyCapsule.forward>
如果我们对函数或模块调用 help()
,我们可以看到它的签名与我们的 C++ 代码匹配
In[4] help(lltm_cpp.forward)
forward(...) method of builtins.PyCapsule instance
forward(arg0: torch::Tensor, arg1: torch::Tensor, arg2: torch::Tensor, arg3: torch::Tensor, arg4: torch::Tensor) -> List[torch::Tensor]
LLTM forward
既然我们现在能够从 Python 中调用 C++ 函数,我们可以将它们用 torch.autograd.Function
和 torch.nn.Module
封装起来,使它们成为 PyTorch 的一等公民。
import math
import torch
# Our module!
import lltm_cpp
class LLTMFunction(torch.autograd.Function):
@staticmethod
def forward(ctx, input, weights, bias, old_h, old_cell):
outputs = lltm_cpp.forward(input, weights, bias, old_h, old_cell)
new_h, new_cell = outputs[:2]
variables = outputs[1:] + [weights]
ctx.save_for_backward(*variables)
return new_h, new_cell
@staticmethod
def backward(ctx, grad_h, grad_cell):
outputs = lltm_cpp.backward(
grad_h.contiguous(), grad_cell.contiguous(), *ctx.saved_tensors)
d_old_h, d_input, d_weights, d_bias, d_old_cell = outputs
return d_input, d_weights, d_bias, d_old_h, d_old_cell
class LLTM(torch.nn.Module):
def __init__(self, input_features, state_size):
super(LLTM, self).__init__()
self.input_features = input_features
self.state_size = state_size
self.weights = torch.nn.Parameter(
torch.empty(3 * state_size, input_features + state_size))
self.bias = torch.nn.Parameter(torch.empty(3 * state_size))
self.reset_parameters()
def reset_parameters(self):
stdv = 1.0 / math.sqrt(self.state_size)
for weight in self.parameters():
weight.data.uniform_(-stdv, +stdv)
def forward(self, input, state):
return LLTMFunction.apply(input, self.weights, self.bias, *state)
性能比较¶
现在我们能够从 PyTorch 中使用和调用 C++ 代码了,我们可以运行一个小型基准测试,看看用 C++ 重写我们的算子带来了多少性能提升。我们将向前和向后运行 LLTM 几次并测量持续时间
import time
import torch
batch_size = 16
input_features = 32
state_size = 128
X = torch.randn(batch_size, input_features)
h = torch.randn(batch_size, state_size)
C = torch.randn(batch_size, state_size)
rnn = LLTM(input_features, state_size)
forward = 0
backward = 0
for _ in range(100000):
start = time.time()
new_h, new_C = rnn(X, (h, C))
forward += time.time() - start
start = time.time()
(new_h.sum() + new_C.sum()).backward()
backward += time.time() - start
print('Forward: {:.3f} s | Backward {:.3f} s'.format(forward, backward))
如果我们在本文档开头用纯 Python 编写的原始 LLTM 运行这段代码,我们会在我的机器上得到以下数字
Forward: 506.480 us | Backward 444.694 us
以及我们新的 C++ 版本
Forward: 349.335 us | Backward 443.523 us
我们已经可以看到前向函数有显著的速度提升(超过 30%)。对于反向函数,速度提升虽然可见,但不是很大。上面我写的反向传播函数并没有特别优化,肯定还有改进空间。此外,PyTorch 的自动微分引擎可以自动并行化计算图,可能会整体上使用更高效的操作流,而且它本身也是用 C++ 实现的,所以预期会很快。尽管如此,这是一个好的开始。
在 GPU 设备上的性能¶
关于 PyTorch 的 ATen 后端,一个很棒的事实是它抽象了你正在运行的计算设备。这意味着我们为 CPU 编写的相同代码也可以在 GPU 上运行,并且各个操作会相应地分派到 GPU 优化的实现。对于某些操作,如矩阵乘法(如 mm
或 addmm),这是一个巨大的优势。让我们看看使用 CUDA 张量运行 C++ 代码能获得多少性能提升。不需要对我们的实现进行任何更改,我们只需从 Python 将张量放入 GPU 内存,可以在创建时添加
device=cuda_device
参数,或在创建后使用 .to(cuda_device)
。
import torch
assert torch.cuda.is_available()
cuda_device = torch.device("cuda") # device object representing GPU
batch_size = 16
input_features = 32
state_size = 128
# Note the device=cuda_device arguments here
X = torch.randn(batch_size, input_features, device=cuda_device)
h = torch.randn(batch_size, state_size, device=cuda_device)
C = torch.randn(batch_size, state_size, device=cuda_device)
rnn = LLTM(input_features, state_size).to(cuda_device)
forward = 0
backward = 0
for _ in range(100000):
start = time.time()
new_h, new_C = rnn(X, (h, C))
torch.cuda.synchronize()
forward += time.time() - start
start = time.time()
(new_h.sum() + new_C.sum()).backward()
torch.cuda.synchronize()
backward += time.time() - start
print('Forward: {:.3f} us | Backward {:.3f} us'.format(forward * 1e6/1e5, backward * 1e6/1e5))
再次比较我们的纯 PyTorch 代码和 C++ 版本,现在它们都运行在 CUDA 设备上,我们再次看到性能提升。对于 Python/PyTorch
Forward: 187.719 us | Backward 410.815 us
以及 C++/ATen
Forward: 149.802 us | Backward 393.458 us
与非 CUDA 代码相比,这是一个巨大的总体加速。然而,通过编写自定义 CUDA 核函数,我们可以从 C++ 代码中获得更多性能,我们稍后会深入探讨。在此之前,让我们讨论另一种构建 C++ 扩展的方法。
JIT 编译扩展¶
之前提到,构建 C++ 扩展有两种方法:使用 setuptools
或即时 (JIT)。在讲解了前一种方法后,让我们详细说明后一种方法。JIT 编译机制提供了一种通过调用 PyTorch API 中的一个简单函数 torch.utils.cpp_extension.load()
来即时编译和加载扩展的方法。对于 LLTM,这看起来就像这样简单
from torch.utils.cpp_extension import load
lltm_cpp = load(name="lltm_cpp", sources=["lltm.cpp"])
在这里,我们向函数提供了与 setuptools
相同的信息。在后台,它将执行以下操作
创建一个临时目录
/tmp/torch_extensions/lltm
,在该临时目录中生成一个 Ninja 构建文件,
将你的源文件编译成共享库,
将此共享库作为 Python 模块导入。
实际上,如果你向 cpp_extension.load()
传递 verbose=True
参数,你将会被告知该过程的详细信息
Using /tmp/torch_extensions as PyTorch extensions root...
Emitting ninja build file /tmp/torch_extensions/lltm_cpp/build.ninja...
Building extension module lltm_cpp...
Loading extension module lltm_cpp...
生成的 Python 模块将与 setuptools 生成的完全相同,但不再需要维护单独的 setup.py
构建文件。如果您的设置更复杂,确实需要 setuptools
的全部功能,您可以编写自己的 setup.py
– 但在许多情况下,这种 JIT 技术已经足够好。第一次运行此行时,需要一些时间,因为扩展是在后台编译的。由于我们使用 Ninja 构建系统来构建您的源文件,重新编译是增量的,因此如果您没有更改扩展的源文件,第二次运行 Python 模块时重新加载扩展会很快,开销很低。
编写混合 C++/CUDA 扩展¶
为了真正将我们的实现提升到新的水平,我们可以使用自定义 CUDA 内核手动编写部分前向和后向传播。对于 LLTM,这特别有效,因为顺序中有大量逐点操作,这些操作都可以在单个 CUDA 内核中融合和并行化。让我们看看如何编写这样的 CUDA 内核,并使用这种扩展机制将其与 PyTorch 集成。
编写 CUDA 扩展的一般策略是首先编写一个 C++ 文件,该文件定义将从 Python 调用的函数,并使用 pybind11 将这些函数绑定到 Python。此外,此文件还将声明在 CUDA (.cu
) 文件中定义的函数。然后,C++ 函数会进行一些检查,并最终将其调用转发给 CUDA 函数。在 CUDA 文件中,我们编写实际的 CUDA 内核。cpp_extension
包将负责使用 C++ 编译器(如 gcc
)编译 C++ 源文件,并使用 NVIDIA 的 nvcc
编译器编译 CUDA 源文件。这确保了每个编译器都能处理其最擅长编译的文件。最终,它们将被链接到一个共享库中,我们可以从 Python 代码中访问该库。
我们将从 C++ 文件开始,例如,我们将其命名为 lltm_cuda.cpp
。
#include <torch/extension.h>
#include <vector>
// CUDA forward declarations
std::vector<torch::Tensor> lltm_cuda_forward(
torch::Tensor input,
torch::Tensor weights,
torch::Tensor bias,
torch::Tensor old_h,
torch::Tensor old_cell);
std::vector<torch::Tensor> lltm_cuda_backward(
torch::Tensor grad_h,
torch::Tensor grad_cell,
torch::Tensor new_cell,
torch::Tensor input_gate,
torch::Tensor output_gate,
torch::Tensor candidate_cell,
torch::Tensor X,
torch::Tensor gate_weights,
torch::Tensor weights);
// C++ interface
#define CHECK_CUDA(x) TORCH_CHECK(x.device().is_cuda(), #x " must be a CUDA tensor")
#define CHECK_CONTIGUOUS(x) TORCH_CHECK(x.is_contiguous(), #x " must be contiguous")
#define CHECK_INPUT(x) CHECK_CUDA(x); CHECK_CONTIGUOUS(x)
std::vector<torch::Tensor> lltm_forward(
torch::Tensor input,
torch::Tensor weights,
torch::Tensor bias,
torch::Tensor old_h,
torch::Tensor old_cell) {
CHECK_INPUT(input);
CHECK_INPUT(weights);
CHECK_INPUT(bias);
CHECK_INPUT(old_h);
CHECK_INPUT(old_cell);
return lltm_cuda_forward(input, weights, bias, old_h, old_cell);
}
std::vector<torch::Tensor> lltm_backward(
torch::Tensor grad_h,
torch::Tensor grad_cell,
torch::Tensor new_cell,
torch::Tensor input_gate,
torch::Tensor output_gate,
torch::Tensor candidate_cell,
torch::Tensor X,
torch::Tensor gate_weights,
torch::Tensor weights) {
CHECK_INPUT(grad_h);
CHECK_INPUT(grad_cell);
CHECK_INPUT(input_gate);
CHECK_INPUT(output_gate);
CHECK_INPUT(candidate_cell);
CHECK_INPUT(X);
CHECK_INPUT(gate_weights);
CHECK_INPUT(weights);
return lltm_cuda_backward(
grad_h,
grad_cell,
new_cell,
input_gate,
output_gate,
candidate_cell,
X,
gate_weights,
weights);
}
PYBIND11_MODULE(TORCH_EXTENSION_NAME, m) {
m.def("forward", &lltm_forward, "LLTM forward (CUDA)");
m.def("backward", &lltm_backward, "LLTM backward (CUDA)");
}
如您所见,它大部分是样板代码、检查以及将调用转发到我们将在 CUDA 文件中定义的函数。我们将此文件命名为 lltm_cuda_kernel.cu
(注意 .cu
扩展名!)。NVCC 可以合理地编译 C++11,因此我们仍然可以使用 ATen 和 C++ 标准库(但不能使用 torch.h
)。请注意,setuptools
无法处理名称相同但扩展名不同的文件,因此如果您使用 setup.py
方法而不是 JIT 方法,则必须为您的 CUDA 文件指定与 C++ 文件不同的名称(对于 JIT 方法,lltm.cpp
和 lltm.cu
可以正常工作)。让我们稍微看看这个文件会是什么样子。
#include <torch/extension.h>
#include <cuda.h>
#include <cuda_runtime.h>
#include <vector>
template <typename scalar_t>
__device__ __forceinline__ scalar_t sigmoid(scalar_t z) {
return 1.0 / (1.0 + exp(-z));
}
在这里,我们看到了我刚刚描述的头文件,以及我们正在使用 CUDA 特定的声明,如 __device__
和 __forceinline__
,以及函数,如 exp
。让我们继续看一些我们将需要的辅助函数。
template <typename scalar_t>
__device__ __forceinline__ scalar_t d_sigmoid(scalar_t z) {
const auto s = sigmoid(z);
return (1.0 - s) * s;
}
template <typename scalar_t>
__device__ __forceinline__ scalar_t d_tanh(scalar_t z) {
const auto t = tanh(z);
return 1 - (t * t);
}
template <typename scalar_t>
__device__ __forceinline__ scalar_t elu(scalar_t z, scalar_t alpha = 1.0) {
return fmax(0.0, z) + fmin(0.0, alpha * (exp(z) - 1.0));
}
template <typename scalar_t>
__device__ __forceinline__ scalar_t d_elu(scalar_t z, scalar_t alpha = 1.0) {
const auto e = exp(z);
const auto d_relu = z < 0.0 ? 0.0 : 1.0;
return d_relu + (((alpha * (e - 1.0)) < 0.0) ? (alpha * e) : 0.0);
}
现在要实际实现一个函数,我们仍然需要两件事:一个执行我们不希望手动显式编写并调用 CUDA 内核的操作的函数,以及一个用于我们希望加速的部分的实际 CUDA 内核。对于前向传播,第一个函数应如下所示:
std::vector<torch::Tensor> lltm_cuda_forward(
torch::Tensor input,
torch::Tensor weights,
torch::Tensor bias,
torch::Tensor old_h,
torch::Tensor old_cell) {
auto X = torch::cat({old_h, input}, /*dim=*/1);
auto gates = torch::addmm(bias, X, weights.transpose(0, 1));
const auto batch_size = old_cell.size(0);
const auto state_size = old_cell.size(1);
auto new_h = torch::zeros_like(old_cell);
auto new_cell = torch::zeros_like(old_cell);
auto input_gate = torch::zeros_like(old_cell);
auto output_gate = torch::zeros_like(old_cell);
auto candidate_cell = torch::zeros_like(old_cell);
const int threads = 1024;
const dim3 blocks((state_size + threads - 1) / threads, batch_size);
AT_DISPATCH_FLOATING_TYPES(gates.type(), "lltm_forward_cuda", ([&] {
lltm_cuda_forward_kernel<scalar_t><<<blocks, threads>>>(
gates.data<scalar_t>(),
old_cell.data<scalar_t>(),
new_h.data<scalar_t>(),
new_cell.data<scalar_t>(),
input_gate.data<scalar_t>(),
output_gate.data<scalar_t>(),
candidate_cell.data<scalar_t>(),
state_size);
}));
return {new_h, new_cell, input_gate, output_gate, candidate_cell, X, gates};
}
这里的主要关注点是 AT_DISPATCH_FLOATING_TYPES
宏和内核启动(由 <<<...>>>
指示)。虽然 ATen 抽象了我们处理的张量的设备和数据类型,但在运行时,张量仍然由具体设备上的具体类型内存支持。因此,我们需要一种方法在运行时确定张量的类型,然后选择性地调用具有相应正确类型签名的函数。手动完成此操作(概念上)如下所示:
switch (tensor.type().scalarType()) {
case torch::ScalarType::Double:
return function<double>(tensor.data<double>());
case torch::ScalarType::Float:
return function<float>(tensor.data<float>());
...
}
AT_DISPATCH_FLOATING_TYPES
的目的是为我们处理这种分发。它接受一个类型(在我们的例子中是 gates.type()
),一个名称(用于错误消息)和一个 lambda 函数。在这个 lambda 函数内部,类型别名 scalar_t
是可用的,它被定义为该上下文中张量在运行时实际的类型。因此,如果我们有一个模板函数(我们的 CUDA 内核将是),我们可以使用这个 scalar_t
别名对其进行实例化,并且将调用正确的函数。在这种情况下,我们还希望将张量的数据指针作为该 scalar_t
类型的指针检索。如果您想分发所有类型而不仅仅是浮点类型(Float
和 Double
),可以使用 AT_DISPATCH_ALL_TYPES
。
请注意,我们使用普通的 ATen 执行一些操作。这些操作仍将在 GPU 上运行,但使用 ATen 的默认实现。这是有意义的,因为 ATen 将使用高度优化的例程来处理矩阵乘法(例如 addmm
)或卷积,这些例程自己实现和改进会困难得多。
至于内核启动本身,我们在此指定每个 CUDA 块将有 1024 个线程,并且整个 GPU 网格将被分成尽可能多的 1 x 1024
线程块,以使我们的矩阵每个组件都有一个线程。例如,如果我们的状态大小是 2048,批次大小是 4,我们将总共启动 4 x 2 = 8
个块,每个块有 1024 个线程。如果您之前从未听说过 CUDA 的“块”或“网格”,可以阅读一篇关于 CUDA 的入门文章。
实际的 CUDA 内核相当简单(如果您以前编写过 GPU 程序的话)。
template <typename scalar_t>
__global__ void lltm_cuda_forward_kernel(
const scalar_t* __restrict__ gates,
const scalar_t* __restrict__ old_cell,
scalar_t* __restrict__ new_h,
scalar_t* __restrict__ new_cell,
scalar_t* __restrict__ input_gate,
scalar_t* __restrict__ output_gate,
scalar_t* __restrict__ candidate_cell,
size_t state_size) {
const int column = blockIdx.x * blockDim.x + threadIdx.x;
const int index = blockIdx.y * state_size + column;
const int gates_row = blockIdx.y * (state_size * 3);
if (column < state_size) {
input_gate[index] = sigmoid(gates[gates_row + column]);
output_gate[index] = sigmoid(gates[gates_row + state_size + column]);
candidate_cell[index] = elu(gates[gates_row + 2 * state_size + column]);
new_cell[index] =
old_cell[index] + candidate_cell[index] * input_gate[index];
new_h[index] = tanh(new_cell[index]) * output_gate[index];
}
}
这里主要有趣的是,我们能够为门控矩阵中的每个单独组件完全并行地计算所有这些逐点操作。如果您想象必须用一个巨大的 for
循环串行处理一百万个元素,您就会明白为什么这会快得多。
使用访问器¶
您可以在 CUDA 内核中看到,我们直接使用正确类型的指针进行操作。确实,在 CUDA 内核内部直接使用高级类型无关的张量效率会非常低。
然而,这会牺牲易用性和可读性,特别是对于高维数据。在我们的例子中,例如,我们知道连续的 gates
张量有 3 个维度:
批次 (batch),大小为
batch_size
,步长为3*state_size
行 (row),大小为
3
,步长为state_size
索引 (index),大小为
state_size
,步长为1
那么,我们如何在内核内部访问元素 gates[n][row][column]
呢?事实证明,您需要步长来通过一些简单的算术访问元素。
gates.data<scalar_t>()[n*3*state_size + row*state_size + column]
除了冗长之外,这个表达式还需要明确已知步长,因此必须将其作为参数传递给内核函数。您可以看到,在内核函数接受多个大小不同的张量的情况下,最终会导致非常长的参数列表。
幸运的是,ATen 提供了访问器,只需一次动态检查即可确认张量的类型和维度数量。然后,访问器会暴露一个 API,用于高效访问张量元素,而无需转换为单个指针。
torch::Tensor foo = torch::rand({12, 12});
// assert foo is 2-dimensional and holds floats.
auto foo_a = foo.accessor<float,2>();
float trace = 0;
for(int i = 0; i < foo_a.size(0); i++) {
// use the accessor foo_a to get tensor data.
trace += foo_a[i][i];
}
访问器对象具有相对高级的接口,带有 .size()
和 .stride()
方法以及多维索引。.accessor<>
接口旨在高效访问 CPU 张量上的数据。CUDA 张量的等效接口是 packed_accessor64<>
和 packed_accessor32<>
,它们生成带有 64 位或 32 位整数索引的 Packed 访问器。
与 Accessor 的根本区别在于,Packed Accessor 将大小和步长数据复制到其结构内部,而不是指向它。这允许我们将其传递给 CUDA 内核函数并在其中使用其接口。
我们可以设计一个接受 Packed 访问器而不是指针的函数。
__global__ void lltm_cuda_forward_kernel(
const torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,3,torch::RestrictPtrTraits> gates,
const torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> old_cell,
torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> new_h,
torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> new_cell,
torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> input_gate,
torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> output_gate,
torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> candidate_cell)
让我们分解这里使用的模板。前两个参数 scalar_t
和 2
与常规 Accessor 相同。参数 torch::RestrictPtrTraits
表示必须使用 __restrict__
关键字。还要注意,我们使用了 PackedAccessor32
变体,它将大小和步长存储在 int32_t
中。这很重要,因为使用 64 位变体(PackedAccessor64
)会使内核变慢。
函数声明变为:
template <typename scalar_t>
__global__ void lltm_cuda_forward_kernel(
const torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,3,torch::RestrictPtrTraits> gates,
const torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> old_cell,
torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> new_h,
torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> new_cell,
torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> input_gate,
torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> output_gate,
torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> candidate_cell) {
//batch index
const int n = blockIdx.y;
// column index
const int c = blockIdx.x * blockDim.x + threadIdx.x;
if (c < gates.size(2)){
input_gate[n][c] = sigmoid(gates[n][0][c]);
output_gate[n][c] = sigmoid(gates[n][1][c]);
candidate_cell[n][c] = elu(gates[n][2][c]);
new_cell[n][c] =
old_cell[n][c] + candidate_cell[n][c] * input_gate[n][c];
new_h[n][c] = tanh(new_cell[n][c]) * output_gate[n][c];
}
}
实现的可读性更高!然后,在主机函数内使用 .packed_accessor32<>
方法创建 Packed 访问器来调用此函数。
std::vector<torch::Tensor> lltm_cuda_forward(
torch::Tensor input,
torch::Tensor weights,
torch::Tensor bias,
torch::Tensor old_h,
torch::Tensor old_cell) {
auto X = torch::cat({old_h, input}, /*dim=*/1);
auto gate_weights = torch::addmm(bias, X, weights.transpose(0, 1));
const auto batch_size = old_cell.size(0);
const auto state_size = old_cell.size(1);
auto gates = gate_weights.reshape({batch_size, 3, state_size});
auto new_h = torch::zeros_like(old_cell);
auto new_cell = torch::zeros_like(old_cell);
auto input_gate = torch::zeros_like(old_cell);
auto output_gate = torch::zeros_like(old_cell);
auto candidate_cell = torch::zeros_like(old_cell);
const int threads = 1024;
const dim3 blocks((state_size + threads - 1) / threads, batch_size);
AT_DISPATCH_FLOATING_TYPES(gates.type(), "lltm_forward_cuda", ([&] {
lltm_cuda_forward_kernel<scalar_t><<<blocks, threads>>>(
gates.packed_accessor32<scalar_t,3,torch::RestrictPtrTraits>(),
old_cell.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>(),
new_h.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>(),
new_cell.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>(),
input_gate.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>(),
output_gate.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>(),
candidate_cell.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>());
}));
return {new_h, new_cell, input_gate, output_gate, candidate_cell, X, gates};
}
后向传播遵循相同的模式,我将不再详细阐述。
template <typename scalar_t>
__global__ void lltm_cuda_backward_kernel(
torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> d_old_cell,
torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,3,torch::RestrictPtrTraits> d_gates,
const torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> grad_h,
const torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> grad_cell,
const torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> new_cell,
const torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> input_gate,
const torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> output_gate,
const torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits> candidate_cell,
const torch::PackedTensorAccessor32<scalar_t,3,torch::RestrictPtrTraits> gate_weights) {
//batch index
const int n = blockIdx.y;
// column index
const int c = blockIdx.x * blockDim.x + threadIdx.x;
if (c < d_gates.size(2)){
const auto d_output_gate = tanh(new_cell[n][c]) * grad_h[n][c];
const auto d_tanh_new_cell = output_gate[n][c] * grad_h[n][c];
const auto d_new_cell =
d_tanh(new_cell[n][c]) * d_tanh_new_cell + grad_cell[n][c];
d_old_cell[n][c] = d_new_cell;
const auto d_candidate_cell = input_gate[n][c] * d_new_cell;
const auto d_input_gate = candidate_cell[n][c] * d_new_cell;
d_gates[n][0][c] =
d_input_gate * d_sigmoid(gate_weights[n][0][c]);
d_gates[n][1][c] =
d_output_gate * d_sigmoid(gate_weights[n][1][c]);
d_gates[n][2][c] =
d_candidate_cell * d_elu(gate_weights[n][2][c]);
}
}
std::vector<torch::Tensor> lltm_cuda_backward(
torch::Tensor grad_h,
torch::Tensor grad_cell,
torch::Tensor new_cell,
torch::Tensor input_gate,
torch::Tensor output_gate,
torch::Tensor candidate_cell,
torch::Tensor X,
torch::Tensor gates,
torch::Tensor weights) {
auto d_old_cell = torch::zeros_like(new_cell);
auto d_gates = torch::zeros_like(gates);
const auto batch_size = new_cell.size(0);
const auto state_size = new_cell.size(1);
const int threads = 1024;
const dim3 blocks((state_size + threads - 1) / threads, batch_size);
AT_DISPATCH_FLOATING_TYPES(X.type(), "lltm_backward_cuda", ([&] {
lltm_cuda_backward_kernel<scalar_t><<<blocks, threads>>>(
d_old_cell.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>(),
d_gates.packed_accessor32<scalar_t,3,torch::RestrictPtrTraits>(),
grad_h.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>(),
grad_cell.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>(),
new_cell.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>(),
input_gate.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>(),
output_gate.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>(),
candidate_cell.packed_accessor32<scalar_t,2,torch::RestrictPtrTraits>(),
gates.packed_accessor32<scalar_t,3,torch::RestrictPtrTraits>());
}));
auto d_gate_weights = d_gates.reshape({batch_size, 3*state_size});
auto d_weights = d_gate_weights.t().mm(X);
auto d_bias = d_gate_weights.sum(/*dim=*/0, /*keepdim=*/true);
auto d_X = d_gate_weights.mm(weights);
auto d_old_h = d_X.slice(/*dim=*/1, 0, state_size);
auto d_input = d_X.slice(/*dim=*/1, state_size);
return {d_old_h, d_input, d_weights, d_bias, d_old_cell, d_gates};
}
将 C++/CUDA 操作与 PyTorch 集成¶
将支持 CUDA 的操作与 PyTorch 集成再次非常简单。如果您想编写 setup.py
脚本,它可能如下所示:
from setuptools import setup
from torch.utils.cpp_extension import BuildExtension, CUDAExtension
setup(
name='lltm',
ext_modules=[
CUDAExtension('lltm_cuda', [
'lltm_cuda.cpp',
'lltm_cuda_kernel.cu',
])
],
cmdclass={
'build_ext': BuildExtension
})
现在我们使用 CUDAExtension()
代替 CppExtension()
。我们可以直接指定 .cu
文件以及 .cpp
文件 – 库会为您处理由此带来的一切麻烦。JIT 机制甚至更简单:
from torch.utils.cpp_extension import load
lltm = load(name='lltm', sources=['lltm_cuda.cpp', 'lltm_cuda_kernel.cu'])
性能比较¶
我们希望通过使用 CUDA 对代码中的逐点操作进行并行化和融合来提高 LLTM 的性能。让我们看看这是否属实。我们可以运行我之前列出的代码来进行基准测试。之前最快的版本是基于 CUDA 的 C++ 代码:
Forward: 149.802 us | Backward 393.458 us
现在使用我们自定义的 CUDA 内核:
Forward: 129.431 us | Backward 304.641 us
性能进一步提升!